O ISQ realiza auditorias ambientais com o objectivo de diagnosticar a situação ambiental de uma organização, mediante determinados critérios de auditoria.

Esta ferramenta de diagnóstico implica uma análise documental, complementada com uma avaliação no terreno das actividades, processos e infraestruturas da organização auditada.

As auditorias ambientais podem aplicar-se nas seguintes vertentes:

• Avaliação de conformidade legal
  Identifica toda a legislação ambiental (requisitos legais) aplicável às actividades, serviços e/ou produtos da organização, potenciais não conformidades legais e oportunidades de melhoria.Este processo resulta na elaboração de um plano de acção, com identificação de medidas preventivas e correctivas a adoptar
• Auditorias ambientais internas, externas e de 2.ª parte (fornecedores e/ou clientes) a Sistemas de Gestão Ambiental (SGA)
  Realizam-se com base nos requisitos da norma ISO 19011 (metodologias de auditoria). Este serviço permite uma avaliação externa e isenta de um sistema de gestão (integrado ou não), identificando não conformidades perante os requisitos normativos e/ou legislativos, assim como oportunidades de melhoria voluntárias.
  Numa outra perspectiva, permite a preparação para auditorias externas (realizadas por entidades certificadoras), em fases de concessão, acompanhamento ou renovação
• Auditorias de desempenho ambiental
  Avaliam a gestão ambiental corrente, mediante critérios predefinidos de auditoria, como por exemplo, requisitos legais, requisitos normativos e/ou requisitos ambientais subscritos voluntariamente pela organização